徐志建，中国科学院上海药物研究所研究员，现任中国化学会计算（机）化学专业委员会委员，曾任Journal of Chemical Information and Modeling首届青年编委。主要从事分子模拟及药物设计方面的研究工作，专注于分子模拟与药物设计新方法的发展，以及这些方法在药物发现方面的应用研究。 共发表论文140余篇，其中3篇论文的引用超过200次。申请国家发明专利50多项，软件著作权5件。 （1）药物-靶标结合作用的理论研究。率先在药物设计中引入卤键，首次通过计算模拟阐明卤键作用与化合物成药性的关系，阐明了卤键作用的本质，帮助人们进一步理解IUPAC的卤键定义。在卤键方面的研究工作被得克萨斯大学Mahesh Narayan教授评价为教科书式的工作（Molecules 2017, 22 (9)）。发现晶体结构数据中的非键相互作用（卤键、氢键、离子键等）被低估。 （2）药物设计方法发展与软件开发。开发了可以处理卤键的分子对接软件D3DOCKxb，将此软件移植到国产超级计算机上，一天可虚拟筛完4200万个化合物。开发了可以分析口袋动力学性质的软件D3Pockets，可以分析口袋的稳定性、连续性与相关性。开发了基于公共空间的多模态药物-靶标关联预测技术MultiDTI，可以关联新化学实体和新靶标到已知的异构网络。开发了抗新冠肺炎药物靶标预测和虚拟筛选平台D3Targets-2019-nCoV。 （3）应用研究。针对肿瘤及传染性疾病等重要疾病靶标蛋白开展药物设计及结构优化研究，发现了一系列活性化合物。利用计算模拟，发现保肝利胆的老药柳胺酚在骨髓瘤方面的新用途，发现抗HIV的老药奈非那韦在抗新冠肺炎方面的新用途，均已完成研究者发起的临床研究。 |
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